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超聲波破碎法提取活性污泥DNA及其DGGE分析

論文類型 技術與工程 發表日期 2008-04-01
來源 哈爾濱工業大學學報
作者 萬晶晶,張汝嘉,邢德峰,謝天卉,趙麗華,任南琪
關鍵詞 超聲波破碎法;活性污泥;DNA提取; PCR;變性梯度凝膠電泳(DGGE)
摘要 為快速提取活性污泥中的微生物DNA,進一步應用于變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術分析其群落結構,采用細胞超聲波破碎法直接提取反應器活性污泥DNA,以16S rRNA V3區域通用引物進行PCR擴增,隨后利用DGGE技術對擴增產物的多樣性進行評估. 結果表明,超聲波破碎法可以快速地提取活性污泥DNA,用超聲波破碎法提取到的活性污泥克服了PCR擴增困難的問題. 在一定的超聲波功率下,超聲時間對DNA產率、PCR擴增效率和DGGE分析均有很大影響,實驗的最佳超聲時間為27 s. DGGE分析表明,用該法提取到的

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